Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP19O94966 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP19O94966 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP19O94966 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP19O94966 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP19O94966 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP19O94966 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP19O94966 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP19O94966 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms