Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms