Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VEGFDO43915 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VEGFDO43915 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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