Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC7A4O43246 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC7A4O43246 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms