Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHADO15335 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHADO15335 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHADO15335 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHADO15335 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHADO15335 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHADO15335 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms