Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMBP2O15034 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMBP2O15034 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms