Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLGNO14967 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLGNO14967 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLGNO14967 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLGNO14967 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLGNO14967 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLGNO14967 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLGNO14967 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLGNO14967 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms