Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
J3KT08 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
J3KT08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
J3KT08 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
J3KT08 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
J3KT08 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms