Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms