Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVV-2B6SEH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms