Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM3A6NNA2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRRM3A6NNA2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms