Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPOPA6NHQ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPOPA6NHQ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms