Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3AA6NCI4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA3AA6NCI4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms