Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAMTA1Q9Y6Y1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms