Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms