Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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