Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP7AQ9Y3A4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRP7AQ9Y3A4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms