Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOD1Q9Y239 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NOD1Q9Y239 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms