Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms