Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX6Q9UNH7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX6Q9UNH7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms