Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZMYND8Q9ULU4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms