Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms