Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZNF608Q9ULD9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms