Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRPF3Q9ULD4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF3Q9ULD4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms