Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRXN1Q9ULB1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms