Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP3Q9UKI2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms