Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CROTQ9UKG9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms