Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GGA1Q9UJY5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms