Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSRAQ9UJ68 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSRAQ9UJ68 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms