Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COPS7AQ9UBW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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