Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ORC3Q9UBD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ORC3Q9UBD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms