Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MBD5Q9P267 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MBD5Q9P267 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms