Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HCN3Q9P1Z3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HCN3Q9P1Z3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms