Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT4Q9P109 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms