Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCAL1Q9NZC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms