Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RDH8Q9NYR8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RDH8Q9NYR8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms