Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMPD3Q9NY59 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMPD3Q9NY59 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.8 ms