Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX43Q9NXZ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX43Q9NXZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms