Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC4Q9NTJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC4Q9NTJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms