Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RRP7BPQ9NSQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms