Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP2Q9NS61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNIP2Q9NS61 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms