Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL17Q9NRX2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL17Q9NRX2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms