Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms