Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms