Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVK-5Q9HDB9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVK-5Q9HDB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms