Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TNRC6CQ9HCJ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNRC6CQ9HCJ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms