Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4Q9HBW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms