Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLMPQ9H6B4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLMPQ9H6B4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLMPQ9H6B4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms