Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRABDQ9H4I3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRABDQ9H4I3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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