Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN3Q9H1Y3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms